研究人员开发新的开源方法来改进单细胞数据的解码

发布时间：2023-10-06 08:56:47 栏目：生活

导读 纪念斯隆凯特琳癌症中心 (MSK) 的研究人员开发了一种新的开源计算方法，称为 Spectra，它改进了单细胞转录组数据的分析。通过以独特的方...

纪念斯隆凯特琳癌症中心 (MSK) 的研究人员开发了一种新的开源计算方法，称为 Spectra，它改进了单细胞转录组数据的分析。



通过以独特的方式指导数据分析，Spectra 可以为细胞之间复杂的相互作用提供新的见解，例如癌细胞和免疫细胞之间的相互作用，这对于改善免疫治疗至关重要。

该团队的方法和研究结果最近发表在《自然生物技术》上。

研究人员指出，Spectra 可以消除技术“噪音”，以识别功能相关的基因表达程序，包括那些新颖的或针对特定生物背景高度特异性的程序。

MSK 斯隆团队在该研究附带的一份研究简报中写道，该算法非常适合研究来自大型患者群体的数据，并找出有临床意义的患者特征，并补充说 Spectra 非常适合在新兴领域识别生物标志物和药物靶标。免疫肿瘤学。

此外，MSK 团队还向世界各地的研究人员免费提供 Spectra 。

“我接受过计算机科学家的培训，”该研究的资深作者、MSK 斯隆凯特林研究所计算和系统生物学项目主席 Dana Pe'er 博士说道。“我构建的每一个工具，我都努力使其变得强大，以便它可以在多种情况下使用，而不仅仅是一种。我还尝试让它们尽可能易于使用。”